Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNA4P05014 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNA4P05014 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IFNA4P05014 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms