Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL2O95198 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms