Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DYSFO75923 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DYSFO75923 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DYSFO75923 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DYSFO75923 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms