Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms