Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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