Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms