Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPHP1O15259 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPHP1O15259 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms