Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNMO15061 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYNMO15061 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYNMO15061 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYNMO15061 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYNMO15061 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYNMO15061 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms