Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F3O00716 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2F3O00716 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F3O00716 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F3O00716 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms