Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAPO00193 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAPO00193 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAPO00193 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAPO00193 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms