Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KR12 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KR12 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KR12 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KR12 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms