Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E9PCH4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E9PCH4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
E9PCH4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E9PCH4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
E9PCH4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms