Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PATL2C9JE40 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PATL2C9JE40 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms