Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RGPD3A6NKT7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms