Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPIPB13A6NJU9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NPIPB13A6NJU9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms