Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP73A6NFT4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms