Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MBD3L4A6NDZ8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms