Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms