Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF1Q9Y6D6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF1Q9Y6D6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms