Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX11Q9Y5W9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX11Q9Y5W9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms