Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP16Q9Y5T5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms