Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPS28Q9Y2Q9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPS28Q9Y2Q9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms