Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SBNO2Q9Y2G9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SBNO2Q9Y2G9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms