Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms