Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM35Q9UPQ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms