Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
ALKQ9UM73 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKQ9UM73 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms