Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms