Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GGA1Q9UJY5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GGA1Q9UJY5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms