Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFDP1Q9UEE9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFDP1Q9UEE9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms