Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NKX1-2Q9UD57 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKX1-2Q9UD57 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms