Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GDE1Q9NZC3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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