Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLN6Q9NWW5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms