Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCLQ9NW38 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCLQ9NW38 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms