Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TBCCD1Q9NVR7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TBCCD1Q9NVR7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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