Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUOX1Q9NRD9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms