Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LHX9Q9NQ69 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LHX9Q9NQ69 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms