Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms