Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REEP4Q9H6H4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms