Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC008592.3-201ENST00000514941 418 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SENP3Q9H4L4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms