Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC90BQ9GZT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms