Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BHLHE41Q9C0J9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms