Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMES1Q9C002 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMES1Q9C002 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMES1Q9C002 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMES1Q9C002 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms