Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMIM3Q9BZL3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms