Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NIFKQ9BYG3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms