Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VN1R3Q9BXE9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms