Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUP58Q9BVL2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms