Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TREX2Q9BQ50 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms