Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMTK3Q96Q04 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms