Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD27Q96NW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD27Q96NW4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms