Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COG8Q96MW5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COG8Q96MW5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms